Почему сайты и социальные сети индексируются по разному ? Все просто они похожи но очень разные. Начнем с сайтов, разные конструкторы и системы управления требуют кроме сайта еще дополнительно, например вордпресс не будет работать без базы SQL и хостинга с корректной версией PHP. Если говорить про закрытые системы то там думать не нужно, за вас подумал хостер. Да и на открытых сейчас все упрощается. 

Имея дело с разными сайтами могу сказать следующее, индексация происходит по разному. Опять же вернемся к вордпрессу, если он настроен правильно то будет все хорошо в поиске. А если там наставлено непонятных расширений туча, могут быть проблемы. Вот закрытые системы в этом плане лучше, нет стороннего кода. Хотя и другая сторона в том что найти ответ на вопрос почти нереально, в виду слабой поддержки и другого.

Социальные сети это тоже сайты тире порталы. Да у них есть приложения в компьютер и телефон. Но начав с истоков все равно сайт. Например фейсбук сделан на PHP, но активно использует javascript и другие технологии , при этом индексация отлично, если вы там активный пользователь страницы бизнеса и группы. А в тик ток поиск работает не очень, хотя постороен от части на системе гугл.